Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDC3Q96F86 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms