Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM4SF18Q96CE8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms