Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD50Q92878 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms