Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms