Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms