Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC39A12Q504Y0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms