Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SNAPC1Q16533 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SNAPC1Q16533 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms