Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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