Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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