Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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