Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms