Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDNQ13061 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms