Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSME1Q06323 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms