Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms