Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms