Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFRD-1P60508 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms