Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THOP1P52888 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
THOP1P52888 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms