Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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HOXD13P35453 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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