Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms