Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OTX2P32243 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTX2P32243 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms