Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms