Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B4P23634 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms