Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms