Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms