Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GP1BBP13224 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms