Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFLP07196 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFLP07196 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFLP07196 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFLP07196 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFLP07196 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFLP07196 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms