Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms