Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms