Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRC1O43663 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRC1O43663 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRC1O43663 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRC1O43663 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms