Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBAL3A6NHL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms