Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEMP2A6NFY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms