Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms