Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms