Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms