Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNA3Q9UI47 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms