Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS2Q9NRF8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms