Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUOX2Q9NRD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms