Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms