Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms