Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms