Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms