Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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