Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms