Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHIPQ8WWQ0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHIPQ8WWQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHIPQ8WWQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHIPQ8WWQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHIPQ8WWQ0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms