Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms