Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms