Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms