Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms