Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCTP1Q6DN14 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms