Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA8Q53HL2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms